1）你是完整的把所有的分区都格式化了吗？如果只是格式化了C区的话，那么其它区的自启动病毒还是可以发作的。正确的处理方法是：
在重装了系统之后，不要直接双击打开任何一个区，用“资源管理器”进入D、E、F等区，点“工具”—“文件夹选项”—“查看”，去掉“隐藏受保护的操作系统文件”前的勾，并选“显示所有文件和文件夹”，确定。这时，盘里会显示出autorun.inf和病毒文件（系统隐藏属性）。删除这两个文件，重启系统就可以了。（对其它分区也要这么做，如果没有就说明没有病毒。不知道病毒文件的话，删除autorun.inf也可以阻止病毒自启动。）
2）回答你题目的问题。目前的U盘病毒MS在dos下是不会启动的，类似的如一些病毒会感染exe文件，但感染的文件在dos下是不会启动的。如常用的ghost.exe即使感染病毒，在dos下运行也不会感染病毒的。
