对于 Windows2000 用户来说，安装系统时分区操作以及使用控制台的方法大同小异。我觉得最大的不同，就是 BOOTCFG 命令了。
在 Windows2000 的控制台中，是没有这个命令的。那么是不是就无法修复因错误的安装顺序造成的启动菜单丢失呢？不是的。
其实，在 Windows2000 的安装过程中，第 5 步所显示的菜单项和 WindowsXP 是不同的。如图，选 “ R ” 后，就可以用已经创建了的紧急修复盘来恢复启动菜单。
下面是其中一篇转贴，说得非常详尽，就不再附图了。
巧用紧急修复盘恢复Win98/2000双启动
Windows 2000推出已有一段时间了，近日随着我的电脑升级，也给爱机装上了Windows 2000，由于还暂未找到我的ESS 56K 内猫的for Win2000驱动程序，故使用了双启动，我的Windows98SE装在C盘，而Win2000装在F盘，两系统相处还算正常。在装Win2000之前，我已用Ghost对C盘作了备份，昨天因Win98系统出了点问题，便花了4分钟将Win98系统还原到C盘，不曾想到双启动菜单就此消失，Win2000不能使用了，重装它太花时间了，幸好事先我已做了份Win2000紧急修复磁盘，现正好派上用场。
一、制作Win2000紧急修复磁盘
1、单击“开始/程序/附件/系统工具/系统信息”，打开“系统信息”窗口；
2、单击“工具/Windows/备份”，打开“备份”窗口；
3、单击“紧急修复磁盘”按钮，找开一提示窗口，要求你插入一张已格式化的空白软盘，单击“确定”；
4、接着便会看到正在复制系统数据的画面，稍等片刻便会看到紧急修复磁盘已成功保存。
二、使用紧急修复盘恢复双启动
1、使用Win98启动盘重新启动系统，选择加载光驱(若你的Win2000安装文件已拷在硬盘上，可以从硬盘启动到Dos界面)；
2、运行Win98文件夹下的“Smartdrv.exe”文件(此步不能少，否则下一步的文件复制时间会很长)，然后转到win2000安装文件夹，执行winnt.exe；
3、可以看到系统正在向硬盘复制安装文件，复制完成后按下回车键重新启动；
4、出现双启动画面，选择第二项更新Win2000系统；
5、按一下“R”键，修复Win2000中文版的安装；
6、在Win2000修复选项画面中，按一下“R”键，使用紧急修复过程修复Win2000的安装；
7、按一下“F”键，选择“快速修复”，执行所有修复选项；
8、按一下“回车键”，使用紧急修复软盘；
9、插入事先做好的Win2000紧急修复软盘，按一下“回车键”，此时可看以正在加载“setup.log”文件中的信息；
10、按一下“回车键”，要安装程序检查驱动器；
11、检查完成后，取出软盘，按下“回车键”重新启动，这时可看到Win98/2000的双启动菜单又会来了。
至此，Windows98/2000双启动恢复成功，最后不要忘了将C盘上多出的临时文件夹($WIN_NT$.~BT、$WIN_NT$.~LS以及$LDR$文件)删除。
