喀纳斯的引人入胜之处还在于千百年来流传的“湖怪”之谜。世代牧居在喀纳斯湖畔的图瓦人,不敢到湖中捕鱼,也不敢前去游泳和划船。历史上,他们的祖辈在湖边放牧,发现牛羊常常神秘失踪。后来发现是湖中有水怪作祟。于是就警示后代说:湖里有“湖怪”,湖怪出现时,湖面上就会狂风怒吼,巨浪排空。在湖边饮水的牛羊,甚至野兽,都会被湖怪吞噬下去。当地老牧民曾回忆,早在上世纪30年代,有人捕到过一条巨鱼,17匹马也运不动它,鱼头直径有2米多长,可以做大锅盛东西。由于这种鱼在繁殖季节鱼体呈红褐色,因此当地人叫它“大红鱼”。这种被称为“湖怪”的大红鱼学名叫“哲罗鲑”。尽管如此,湖怪之谜并没有真正揭开,由于这里经历了三次大的古冰川作用,湖泊形成年代久远,地貌特殊,也可能湖水中生存着大型生物。